Juoksukoulutoiminta on osa seuran yleisurheilukoulu-toimintaa. Juoksu on mukana kaikissa lajeissa. Monipuolinen harjoittelu on SUL:n teema nykypäivänä matkalla kohti aikuis- ja huippu-urheilua. Toiveena olisi, että seuran jokainen yleisurheilukouluharjoitus talvella alkaisi lyhyellä ulkolenkillä, jolloin juoksua saadaan harjoituksiin mukaan.
Etelä-Pohjanmaalla nuoret osallistuvat aktiivisesti piirin juoksukoulukilpailusarjaan. Juoksukoulusarjaan on tehty pieniä muutoksia vuosien aikana. Juoksukoulukilpailu huipentuu edelleen perinteisesti Kuortaneen Maastofinaaliin.